Das Engagement der Johanniter in Polen begann in den sechziger Jahren. Unterstützung in Form von Paketen erhielten die ärmsten und schwächsten Mitglieder der Gesellschaft. Man muss sich darüber im Klaren sein, dass diese Liebesgaben nur ein Tropfen auf den heißen Stein waren und nicht alle Bedürftigen erreicht werden konnten.
Echte Hilfe brachte in den 80er Jahren der Beginn der Transporte, mit denen Medikamente, Lebensmittel, Bekleidung geliefert und später auch Geldbeträge überbracht wurden.
Mit der Widervereinigung im Jahr 1990 ergab sich für die Johanniter eine einmalige Chance ihr Engagement weiter zu verstärken. Dies geschah überwiegend durch die Gründung von Sozialstationen. Eine Wende nahm das Engagement der Johanniter in Polen mit der Konzeption
„Johanniter 2000“, dem Richtung weisenden Papier der Ordensregierung für den Eintritt ins neue Jahrtausend. Gemäß dieser Konzeption wurde eine Kommission des Johanniterordens und der Johanniter-Unfall-Hilfe e.V. einberufen mit dem Ziel, Wege und Mittel zu finden, wie die derzeitigen und zukünftigen Tätigkeiten in Polen koordiniert werden könnten. Diese Kommission beschloss im Mai 2001, das seitens der Johanniter-Unfall-Hilfe e.V. eine Evaluierung hinsichtlich der möglichen Geschäftsfelder, der Finanzierung sowie der rechtlichen Ausgestaltung von sozialen Dienstleistungen des Ordens und seiner Werke in Polen durchgeführt werden soll.

Die Studie ergab einen grundsätzlichen Bedarf an Dienstleistungen im Bereich des Gesundheitswesens, der unter anderem von privaten Anbietern gedeckt werden könnte.
Das Ordenskapitel, das sich in seiner Herbstsitzung am 10 / 11 November 2001 über die Frage des künftigen Engagements des Ordens in Polen beriet, fasste auf der Grundlage der Vorschläge der Kommission den Beschluss ein Werk der Johanniter in Polen zu gründen.

Auf der Grundlage dieses Beschlusses wurde in der Sitzung der Kommission am 23. November 2002 in Berlin beschlossen zunächst eine Stiftung mit dem Namen „ Stiftung der Johanniter“ zu gründen.
Am 25. März 2003 erfolgte die Eintragung der „Stiftung der Johanniter“ in Polen in das polnische Handelsregister und am 11. Juni 2003 erteilte das Finanzamt für Warschau die Steueridentifizierungsnummer. Damit war die Stiftung registriert und einsatzbereit.

Die Gründung des JDP erfolgte im Jahr 2004. Es wurde am 16.08.2004 ins Vereinsregister eingetragen und nahm seine Arbeit auf.