In seiner Struktur gliedert sich das JDP in den Vorstand, das Präsidium und die Mitgliederversammlung. Der Vorstand besteht aus drei Mitgliedern  von denen eines ein Mitglied des Johanniterordens sein muss.

Es sind dies:

Przemysław Florjanowicz -Błachut (ehrenamtlich, Jahrgang 1978, Jurist, Mitglied der Kommende der Balley des JO, Warschau)

Friedrich Adolph Freiherr von Dellingshausen (ehrenamtlich, Jahrgang 1938, Oberst a.D., Berlin)

Damian Olaf Kardymowicz (Geschaeftsfuehrer, Lidzbark Warmiński / Heilsberg)

Zur Zeit sind 2 Vorstandsmitglieder die Mitglieder des Johanniterordens.

Die Mitglieder des Vereinsvorstands werden vom Präsidium vorgeschlagen und von der Mitgliederversammlung gewählt. Die Amtsdauer beträgt vier Jahre. Der Vorstand kann durch Beschluss und mit Zustimmung des Präsidiums Regionalverbände in Polen gründen.

Aufgabe des Vorstandes ist die Sicherstellung der Tätigkeit entsprechend der Satzung und die Verwaltung des Vermögens des Hilfswerkes in eigener Verantwortung. Er vertritt das Hilfswerk gerichtlich und außergerichtlich. Das Präsidium des Hilfswerkes besteht aus dem Präsidenten und weiteren vier Mitgliedern. Der Praesident und Vizepreaesident muessen Mitglieder des Johanniterordens sein.

Es sind:

• Grzegorz Giemza (Präsident, ev. Geistliche, Chef der CME - Zentrum der Evangelisation und Mission der Ev. Kirche in Polen, Dzięgielów, Schlesien)
• Dr. Johannes Niewerth (Vizepräsident, Rechtsanwalt in Berlin, Mitglied der Schlesischen Genossenschaft des JO)
• Krzysztof Pietrzkiewicz  (Präsidiumsmitglied, Arzt, Posen)
• Dr. Niels von Redecker (Präsidiumsmitglied, Jahrgang 1970, Jurist und Historiker, Mitglied der Brandenburgischen Provinzial-Genossenschaft des JO, Warschau)
• Marek Buzek (Praesidiumsmitglied, Jahrgang 1974, Bankkaufmann in Warschau, Mitglied der Kommende der Balley des JO)